13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0748 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0748  TonB family protein  100 
 
 		 129 aa  250  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.491614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  39.02 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  39.44 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.65 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.18 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  37.5 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  37.5 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  39.47 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  37.5 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  31.51 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.73 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  32.89 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  35.21 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>