30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0557 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  208  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  51.11 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  46.07 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  46.81 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  44.05 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  44.16 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  36.59 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  44.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  44.05 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  41.56 
 
 
87 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  40.58 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  30.12 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  38.57 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  37.08 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  38.03 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  48.94 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  40.59 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  40.3 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  37.63 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  37.35 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  43.37 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  37.68 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  36.26 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>