85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0427 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  220  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  58.33 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  47.95 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  43.59 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  37.78 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  44.44 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  43.59 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  44.74 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  44.74 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  42.31 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  45.83 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  41.56 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  43.84 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  41.89 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  40.26 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  37 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  38.96 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  38.82 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  40.26 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  42.11 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  41.03 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  39.19 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  39.19 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  36 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  40.26 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  40.26 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  37.66 
 
 
96 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  35.62 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5507  hypothetical protein  40.51 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.754805  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69820  hypothetical protein  41.03 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.240173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6031  hypothetical protein  42.31 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  48.24 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2405  hypothetical protein  43.24 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47800  hypothetical protein  39.02 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0117434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0289  hypothetical protein  41.57 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0258  hypothetical protein  40.26 
 
 
115 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0191  hypothetical protein  38.36 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0196  protein of unknown function DUF526  46.55 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.608689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  38.67 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0238  hypothetical protein  40.54 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0237  hypothetical protein  45.76 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186127  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0060  hypothetical protein  30.26 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  46.75 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0215  protein of unknown function DUF526  44.83 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000337039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0340  hypothetical protein  43.1 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0828  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0115743  normal  0.291701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  39.08 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3219  hypothetical protein  38.57 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0650  hypothetical protein  36.99 
 
 
201 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  36.78 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0194  hypothetical protein  38.57 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1399  hypothetical protein  38.57 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0486  hypothetical protein  38.57 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2826  hypothetical protein  38.57 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.865943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5144  hypothetical protein  40.68 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3160  hypothetical protein  39.44 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0552174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0081  hypothetical protein  38.57 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.261842  normal  0.96148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  34.72 
 
 
85 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0406  hypothetical protein  47.83 
 
 
201 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  38.89 
 
 
83 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4191  hypothetical protein  43.64 
 
 
84 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.975481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6196  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2253  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0255  hypothetical protein  48.89 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2784  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2922  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2878  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2867  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0467  hypothetical protein  37.14 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0524  protein of unknown function DUF526  41.82 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0641  hypothetical protein  31.17 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2124  hypothetical protein  29.33 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5235  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5296  hypothetical protein  42.11 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2390  hypothetical protein  34.41 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  51.39 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2020  protein of unknown function DUF526  34.41 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.271189  normal  0.774588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0625  hypothetical protein  31.17 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0436  hypothetical protein  35.71 
 
 
83 aa  40  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>