44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0040 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  69.74 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  61.45 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  48.68 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  45.05 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  47.5 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  40.82 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  48.68 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  47.5 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  39.25 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  46.05 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  46.91 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  46.75 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  43.42 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  56 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  46.75 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  47.3 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  44.74 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  39.77 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  40.96 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  43.33 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  43.33 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  48.51 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  44.16 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  42.68 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  42.22 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  46.58 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  46.58 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  35.96 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  34.07 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  34.07 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  38.96 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  42.73 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  40.54 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  38.96 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0828  hypothetical protein  37.66 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0115743  normal  0.291701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  39.29 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3655  hypothetical protein  44 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3454  hypothetical protein  34.85 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0780  hypothetical protein  33.82 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000301907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>