25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0396 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0396  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  203  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2093  hypothetical protein  51.35 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2341  hypothetical protein  50.6 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3219  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0170349  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2587  hypothetical protein  44.44 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1058  conserved hypothetical protein-like protein  40.21 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0490  hypothetical protein  46.91 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0891  hypothetical protein  41.76 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0265924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1270  hypothetical protein  49.4 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14613  normal  0.34502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2174  hypothetical protein  45.68 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0046  hypothetical protein  42.53 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2334  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000737032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1324  hypothetical protein  49.25 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.214689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1469  hypothetical protein  42.11 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000360016  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1196  hypothetical protein  44.16 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0518  hypothetical protein  31.91 
 
 
99 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3288  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
488 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.922418  normal  0.103144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
340 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 
341 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  22.83 
 
 
344 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  29.85 
 
 
337 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  23.38 
 
 
344 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  25.3 
 
 
337 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
337 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>