13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4168 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  56.81 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  55.25 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  54.9 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  52.34 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  52.69 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0896  hypothetical protein  28.77 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5009  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  36.71 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  33.49 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  31.64 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  27.54 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>