27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0643 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0643  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  73.05 
 
 
142 aa  190  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1085  hypothetical protein  61.79 
 
 
125 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  48.18 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  43.85 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  42.42 
 
 
134 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  42.65 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  33.61 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  41.18 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  32.97 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  32.97 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  32.61 
 
 
139 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  32.61 
 
 
139 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  32.61 
 
 
139 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  32.61 
 
 
139 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  35.62 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  35.62 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  35.62 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  35.62 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  34.52 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  34.25 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  34.25 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>