18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0509 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  82.28 
 
 
79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  79.75 
 
 
79 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  78.48 
 
 
79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  77.22 
 
 
79 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  64.47 
 
 
77 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  100  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  100  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  100  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  63.16 
 
 
77 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  65.79 
 
 
77 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3417  hypothetical protein  65.75 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.20362  normal  0.0892674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  40.51 
 
 
79 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  40.51 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  37.97 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>