19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1440 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1440  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  312  8e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0314502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0367  protein of unknown function DUF450  44.52 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0461  protein of unknown function DUF450  39.6 
 
 
151 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2919  hypothetical protein  39.01 
 
 
150 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2421  hypothetical protein  38.19 
 
 
149 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1807  protein of unknown function DUF450  38.19 
 
 
155 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.648369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11283  hypothetical protein  37.84 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0947  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  107  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.138847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1250  protein of unknown function DUF450  41.18 
 
 
153 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344127  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1526  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1997  hypothetical protein  39.82 
 
 
153 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0838  hypothetical protein  33.64 
 
 
418 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0754  hypothetical protein  29.75 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.774812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  36.27 
 
 
687 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  29.45 
 
 
657 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 
738 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.01 
 
 
654 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  27.08 
 
 
815 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  27.43 
 
 
796 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.708606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>