47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1098 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  100 
 
 		 79 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.5 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  54.43 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.56 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.5 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  46.05 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.74 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.73 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.44 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.97 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  41.54 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  38.46 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.3 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.27 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.88 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.88 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.46 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  35.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.1 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  45.1 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.94 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.1 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.14 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  31.34 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.25 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.66 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  29.85 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  29.85 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.85 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  66.67 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011079  SNSL254_B0005  hypothetical protein  55.88 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.730724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  28.07 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2584  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.72 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0002  hypothetical protein  52.94 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>