15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BLD_0124  CDS  NC_010816  146898  148235  1338  galactoside permease  YP_001954068  unclonable  6.88669e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0272  CDS  NC_010816  341048  341941  894  membrane protein  YP_001954216  unclonable  2.92393e-07  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0308  CDS  NC_010816  386573  388897  2325  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  YP_001954252  unclonable  0.00325244  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0403  CDS  NC_010816  483770  484615  846  30S ribosomal protein S2  YP_001954347  unclonable  7.8779e-08  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0689  CDS  NC_010816  788668  790047  1380  trigger factor  YP_001954633  unclonable  3.80818e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1093  CDS  NC_010816  1284109  1284486  378  hypothetical protein  YP_001955037  unclonable  5.90144e-09  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1358  CDS  NC_010816  1572090  1573598  1509  DNA mismatch repair protein  YP_001955301  unclonable  2.49397e-05  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1359  CDS  NC_010816  1573605  1574876  1272  site-specific DNA methylase  YP_001955302  unclonable  3.54899e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1547  CDS  NC_010816  1840000  1841034  1035  putative beta-xylosidase  YP_001955490  unclonable  6.31807e-07  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1548  CDS  NC_010816  1841452  1842768  1317  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  YP_001955491  unclonable  3.92798e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1882  CDS  NC_010816  2238263  2238541  279  hypothetical protein  YP_001955825  unclonable  1.63845e-09  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1883  CDS  NC_010816  2238732  2238914  183  hypothetical protein  YP_001955826  unclonable  1.02354e-09  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1884  CDS  NC_010816  2239177  2239434  258  hypothetical protein  YP_001955827  unclonable  1.90452e-09  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1885  CDS  NC_010816  2239531  2239878  348  hypothetical protein  YP_001955828  unclonable  4.97643e-09  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_1886  CDS  NC_010816  2240072  2241592  1521  Xylulose kinase  YP_001955829  unclonable  2.34527e-05  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>