24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VEA_000195  CDS  NC_013457  211378  211917  -  540  cytochrome b561  YP_003287348  unclonable  0.000000000187144  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000196  CDS  NC_013457  212092  212334  -  243  hypothetical protein  YP_003287349  unclonable  0.0000000000484737  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000297  CDS  NC_013457  320477  321715  +  1239  oxalate/formate antiporter  YP_003287450  unclonable  0.00000000377663  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000327  CDS  NC_013457  372025  372993  +  969  transcriptional regulator AraC family  YP_003287480  unclonable  0.000000000791228  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000328  CDS  NC_013457  373081  373467  +  387  HTH-type transcriptional regulator CueR  YP_003287481  unclonable  0.0000000000737909  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000329  CDS  NC_013457  373522  374277  -  756  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  YP_003287482  unclonable  0.000000000365879  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000330  CDS  NC_013457  374280  375230  -  951  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287483  unclonable  0.000000000947678  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000331  CDS  NC_013457  375223  376092  -  870  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287484  unclonable  0.000000000524649  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000332  CDS  NC_013457  376181  377089  -  909  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  YP_003287485  unclonable  0.000000000938047  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000448  CDS  NC_013457  511526  513604  -  2079  VgrG protein  YP_003287601  unclonable  0.000000107078  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000449  CDS  NC_013457  513677  514195  -  519  Hcp protein  YP_003287602  unclonable  0.000000000134513  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000565  CDS  NC_013457  663012  664358  +  1347  putative magnesium transporter MgtE  YP_003287716  unclonable  0.000000005121  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000606  CDS  NC_013457  704731  705873  -  1143  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  YP_003287757  unclonable  0.00000000126678  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000960  CDS  NC_013457  1091038  1091391  +  354  hypothetical protein  YP_003288110  unclonable  0.000000000106853  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001153  CDS  NC_013457  1320135  1320647  -  513  hypothetical protein  YP_003288303  unclonable  0.000000000282051  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001284  CDS  NC_013457  1459702  1461807  -  2106  putative iron(III) compound receptor  YP_003288432  unclonable  0.000000165675  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001285  CDS  NC_013457  1461995  1463806  +  1812  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  YP_003288433  unclonable  0.0000000363731  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001392  CDS  NC_013457  1576352  1577203  -  852  beta-lactamase  YP_003288540  unclonable  0.000000000730239  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001393  CDS  NC_013457  1577470  1578792  +  1323  putative oxidoreductase  YP_003288541  unclonable  0.00000000700174  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001520  CDS  NC_013457  1716965  1717645  +  681  acyl dehydratase  YP_003288668  unclonable  0.000000000377103  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001521  CDS  NC_013457  1717705  1718529  -  825  ABC transporter substrate-binding protein  YP_003288669  unclonable  0.000000000647387  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001592  CDS  NC_013457  1806347  1807546  -  1200  putative lipoprotein  YP_003288738  unclonable  0.00000000686161  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001593  CDS  NC_013457  1807637  1808305  +  669  putative two-component response regulator  YP_003288739  unclonable  0.000000000660606  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_rna015  rRNA  NC_013457  988310  989855  -  1546  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000149814  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>