More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ala-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.410035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0487  tRNA-Ala  92.42 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.112524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  5.23195e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.40506e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0015  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00408326  hitchhiker  0.00315011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0054  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.24955e-07  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  2.63771e-05  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0006  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.38481e-05  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.50301e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  2.92455e-05  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.6342e-05  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0011  tRNA-Ala  90 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000293397  hitchhiker  0.000919348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0010  tRNA-Ala  89.04 
 
 
73 bp  81.8  2e-14  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.451721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.90105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  8.78402e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0186  tRNA-Ala  89.04 
 
 
73 bp  81.8  2e-14  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.67693e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.41452e-05  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.51596e-08  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.56554e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.19828e-07  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.0642e-05  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  94.23 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  88.16 
 
 
79 bp  79.8  8e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0878  tRNA-Ala  95.83 
 
 
73 bp  79.8  8e-14  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0453469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.57856e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.45993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  88.16 
 
 
79 bp  79.8  8e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t10  tRNA-Ala  89.55 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t49  tRNA-Ala  89.55 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  89.55 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>