More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0487 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0487  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.112524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 78 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00002  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00307219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00060  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0512928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00072  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0005  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00430225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0076  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000601074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0011  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0436248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4599  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000253863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4642  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000860884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4269  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00650641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0197  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000401396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0274  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119216  normal  0.944216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0078  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4220  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00471797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4715  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4703  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0003  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.548376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0007  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00495936  normal  0.0650768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0215  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00974156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4463  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0383227  hitchhiker  0.000721732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0290  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0570234  normal  0.459614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4122  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000949102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0007  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00023262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5292  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000452405  normal  0.257864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0052  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0311944  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0024  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000443957  unclonable  0.00000686591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0006  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0023212  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5005  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0008  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000639755  hitchhiker  0.000460021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5093  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000403795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0089  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000026686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4540  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0026423  hitchhiker  0.00000000000427901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0014  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3572  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000440761  normal  0.421667 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0118  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000597046  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0274  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00335921  normal  0.424376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0279  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106788  normal  0.58807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4316  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0676327  normal  0.201068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4459  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00362002  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0293  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000102262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4376  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4376  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000605236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4345  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0446638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0214  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000452405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0017  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5076  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000555714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4197  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0213106  normal  0.765485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0093  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0096  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0013  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00682305  normal  0.0131839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0095  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t49  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00468  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06829  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0008  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000976028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0080  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00215161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0021  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0879619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>