More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2888 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
293 aa  602  1e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  7.79832e-10  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
293 aa  602  1e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.43845e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  89.35 
 
 
292 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.58302e-06  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  86.6 
 
 
298 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  85.91 
 
 
298 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.28 
 
 
292 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.62 
 
 
292 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.62 
 
 
292 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.62 
 
 
292 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3009  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.62 
 
 
292 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.44313e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2899  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.0122e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1069  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0224782  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  83.28 
 
 
292 aa  506  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.28996e-05  normal  0.109172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02467  hypothetical protein  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000137745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02503  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  8.96223e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3004  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.43328e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1060  ATP-NAD/AcoX kinase  82.94 
 
 
292 aa  504  1e-142  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.77429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.59 
 
 
292 aa  504  1e-142  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  81.1 
 
 
292 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3855  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.59 
 
 
292 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.47787e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  79.73 
 
 
292 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  67.25 
 
 
301 aa  414  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2474  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.69 
 
 
297 aa  357  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0379  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.7 
 
 
294 aa  357  1e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.520886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.17 
 
 
292 aa  355  4e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.31242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.9 
 
 
309 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.29952e-05  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.19 
 
 
292 aa  348  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.70492e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.55 
 
 
309 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.55 
 
 
309 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.96073e-06  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.04 
 
 
307 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  8.15034e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.21 
 
 
292 aa  345  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  57.09 
 
 
291 aa  346  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.85 
 
 
309 aa  345  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.41976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.9 
 
 
292 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.7 
 
 
292 aa  344  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.44 
 
 
294 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  57.44 
 
 
294 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.01 
 
 
309 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  56.55 
 
 
299 aa  342  3e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0650  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.48 
 
 
305 aa  341  8e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.55 
 
 
309 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.02127e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.36 
 
 
292 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  5.40691e-08  hitchhiker  4.51072e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.36 
 
 
309 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.2487e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.36 
 
 
309 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.36 
 
 
309 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.75505e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  56.06 
 
 
291 aa  337  1e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3824  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.98 
 
 
293 aa  334  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.57 
 
 
293 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.95 
 
 
296 aa  271  8e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.95 
 
 
315 aa  271  8e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.6 
 
 
296 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.1 
 
 
295 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  45.26 
 
 
293 aa  268  6e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.92 
 
 
295 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.26 
 
 
296 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.02 
 
 
294 aa  266  3e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.92 
 
 
295 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.72182e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.92 
 
 
295 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  9.72456e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47 
 
 
296 aa  259  5e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47 
 
 
296 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.5 
 
 
296 aa  254  1e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.75 
 
 
294 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  42.16 
 
 
290 aa  243  2e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  44.24 
 
 
309 aa  243  4e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.1 
 
 
299 aa  243  4e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.1 
 
 
299 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.55 
 
 
294 aa  234  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  41.7 
 
 
290 aa  233  2e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  42.01 
 
 
290 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.28 
 
 
340 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  1.08776e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.58 
 
 
291 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.28 
 
 
295 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.28 
 
 
295 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.58 
 
 
291 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  38.75 
 
 
303 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  41.4 
 
 
293 aa  222  5e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  40.34 
 
 
293 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.75 
 
 
339 aa  220  2e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  7.29399e-06  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.88 
 
 
339 aa  219  4e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.26818e-11  hitchhiker  2.84944e-05 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.21 
 
 
297 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  41.81 
 
 
292 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.93 
 
 
298 aa  212  6e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  39.19 
 
 
294 aa  212  6e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1479  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.34 
 
 
307 aa  211  8e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  38.97 
 
 
291 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  37.46 
 
 
285 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  35.69 
 
 
302 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.46 
 
 
300 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.51 
 
 
299 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.87 
 
 
318 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.76 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.68 
 
 
298 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.93 
 
 
303 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.46 
 
 
300 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.67 
 
 
298 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.9 
 
 
298 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.23 
 
 
298 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.9 
 
 
298 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>