39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0658 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 365 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  91.26 
 
 		 361 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0729  putative flagellar hook-length control protein  85.61 
 
 		 266 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  46.39 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  44.79 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  43.75 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  39.64 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  36.08 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  32.61 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  40.43 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  37.07 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  34.94 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  32.26 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  30.43 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  30.43 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4663  flagellar hook-length control protein  38.64 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  32.97 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  29.9 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  37.97 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1656  flagellar hook-length control protein  25.44 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.410936  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 585 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  28.72 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 586 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.39 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 717 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 702 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  29.36 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 718 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  27.52 
 
 		 579 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.43 
 
 		 674 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  27.7 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  29.27 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  29.33 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>