13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0636 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  98.58 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  98.58 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  34.81 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  31.3 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  29.23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  26.61 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  29.41 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>