20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3126 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3126  antitermination protein  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0683  gp23  47.92 
 
 		 267 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000011637  decreased coverage  0.0000000557011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10027  late gene regulator  51.76 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00412931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0302  antitermination protein Q  51.76 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00725  hypothetical protein  51.76 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00315899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3883  antitermination protein Q  50.59 
 
 		 207 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2089  hypothetical protein  59.09 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1442  antitermination protein Q  48 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3153  antitermination protein Q  48 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000826081  hitchhiker  0.0000000000302422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1846  antitermination protein Q  48 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000732258  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1261  antitermination protein Q  46.67 
 
 		 273 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00132968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2278  antitermination protein  41.33 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0140366  hitchhiker  2.0380900000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1766  antitermination protein  38.67 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4452  antitermination protein  40 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000674008  unclonable  0.00000000121493 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2084  antitermination protein  38.67 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000058866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2077  antitermination protein  38.67 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1132  antitermination protein Q  35.8 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.93895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1062  antitermination protein Q  35.8 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  hitchhiker  0.00000357923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1094  antitermination protein Q  35.8 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176875 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4919  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.342762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>