More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0062 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1671  OsmC family protein  83.69 
 
 
142 aa  226  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  77.3 
 
 
141 aa  212  2e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  69.5 
 
 
141 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  69.78 
 
 
141 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2957  OsmC family protein  69.01 
 
 
141 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  63.83 
 
 
141 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  60.71 
 
 
139 aa  182  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  60.71 
 
 
139 aa  182  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  60.71 
 
 
139 aa  182  1e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  60.71 
 
 
139 aa  182  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  60 
 
 
139 aa  181  2e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  61.15 
 
 
139 aa  182  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  61.15 
 
 
139 aa  182  2e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  60.43 
 
 
139 aa  181  2e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  61.15 
 
 
139 aa  182  2e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  60 
 
 
139 aa  181  2e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  61.43 
 
 
139 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.54891e-10  decreased coverage  4.99481e-08 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  62.94 
 
 
140 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  68.31 
 
 
141 aa  180  5e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  59.29 
 
 
139 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  59.29 
 
 
139 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  60.43 
 
 
139 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  60.43 
 
 
139 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  61.43 
 
 
139 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  60.43 
 
 
139 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  60.14 
 
 
140 aa  177  3e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  60.71 
 
 
142 aa  178  3e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  63.5 
 
 
141 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  63.04 
 
 
141 aa  176  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  63.77 
 
 
141 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  63.77 
 
 
141 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  64.23 
 
 
142 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  62.77 
 
 
142 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  63.5 
 
 
142 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  61.7 
 
 
140 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  63.77 
 
 
141 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  60.87 
 
 
141 aa  173  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  62.32 
 
 
141 aa  173  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  69.01 
 
 
141 aa  172  1e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  58.04 
 
 
140 aa  172  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  60.43 
 
 
140 aa  172  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  60.99 
 
 
142 aa  172  1e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  63.04 
 
 
141 aa  171  2e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  62.41 
 
 
142 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  60.58 
 
 
139 aa  170  6e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  9.25834e-09  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  62.77 
 
 
142 aa  170  8e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  66.2 
 
 
141 aa  169  8e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  59.42 
 
 
141 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  58.7 
 
 
141 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  60.58 
 
 
139 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  60.14 
 
 
140 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  58.7 
 
 
141 aa  168  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  60.14 
 
 
141 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  60.87 
 
 
142 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  65.49 
 
 
141 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  65.49 
 
 
141 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  56.74 
 
 
141 aa  166  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  59.85 
 
 
139 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.86572e-09  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  58.39 
 
 
140 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  57.45 
 
 
140 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  62.86 
 
 
142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  58.99 
 
 
141 aa  163  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  56.64 
 
 
140 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  57.97 
 
 
140 aa  162  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  56.52 
 
 
141 aa  162  2e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  59.29 
 
 
141 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  55.24 
 
 
140 aa  160  5e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  64.71 
 
 
141 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  57.14 
 
 
141 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2305  organic hydroperoxide resistance protein  62.86 
 
 
142 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43609  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  56.52 
 
 
140 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  60.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  60.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  60.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  60.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  60.14 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  60.14 
 
 
142 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  57.55 
 
 
140 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  59.42 
 
 
141 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  57.55 
 
 
141 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  55.07 
 
 
142 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  58.7 
 
 
142 aa  151  3e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  54.74 
 
 
147 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  61.59 
 
 
141 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  53.24 
 
 
142 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  56.83 
 
 
141 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  55.32 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  55.32 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  52.86 
 
 
190 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  55.32 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.32 
 
 
141 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  54.68 
 
 
138 aa  146  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  55.07 
 
 
140 aa  145  2e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  55.07 
 
 
140 aa  145  2e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  52.86 
 
 
141 aa  145  2e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  48.95 
 
 
142 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  49.29 
 
 
141 aa  140  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  54.35 
 
 
142 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  56.2 
 
 
140 aa  139  1e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  9.50914e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>