271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3726 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4803  OsmC family protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561854  normal  0.509751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3726  OsmC family protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05440  organic hydroperoxide resistance protein  91.61 
 
 		 144 aa  271  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0775032  normal  0.0321725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  51.43 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  52.9 
 
 		 142 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  54.68 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  52.9 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  52.99 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  52.9 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  51.77 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  51.47 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  51.09 
 
 		 139 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  50.35 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  50.36 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  50.36 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  48.91 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  51.45 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  51.47 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  52.17 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  49.64 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  49.64 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  49.64 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  54.35 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  48.55 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  50.36 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  51.41 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  48.92 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  48.18 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  50.36 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  49.64 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  49.64 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  51.47 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  50.72 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  49.26 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  49.64 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  49.64 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  50 
 
 		 190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  51.43 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  49.64 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  48.18 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  48.57 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  48.91 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  48.91 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1386  OsmC family protein  51.09 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  50.74 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  48.94 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  49.65 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  49.65 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  48.92 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  51.08 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  48.53 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.86 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  49.26 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  49.26 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  48.53 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.53 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  47.1 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  47.1 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  45.99 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  45.99 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  49.26 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  47.1 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  51.47 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1671  OsmC family protein  50.71 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  50.35 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0976  organic hydroperoxide resistance protein  48.91 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  46.04 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  48.55 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  46.04 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  49.64 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  49.26 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3057  OsmC family protein  48.91 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  47.79 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  48.91 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  48.53 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.44 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  46.43 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  49.29 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  49.26 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  47.83 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  47.79 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3209  OsmC family protein  48.91 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  47.1 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  47.06 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  45 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  51.77 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>