15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0059 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  564  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  51.64 
 
 
285 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  26.61 
 
 
271 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  26.96 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  26.84 
 
 
323 aa  83.2  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54624e-07 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  25.59 
 
 
279 aa  82  9e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  26.6 
 
 
277 aa  79.3  7e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  27.23 
 
 
273 aa  67  3e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  65.1  1e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  23.3 
 
 
278 aa  63.2  4e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  25.1 
 
 
299 aa  59.7  5e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  27.87 
 
 
352 aa  59.3  7e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  25.2 
 
 
203 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  21.1 
 
 
309 aa  55.5  8e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  33.72 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>