20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4257 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  91.3 
 
 
3275 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  68.75 
 
 
577 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  81.48 
 
 
522 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  78.57 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  49.32 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  87.5 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  46.15 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  64.86 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  90.91 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  55.26 
 
 
336 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  63.41 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  95 
 
 
156 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  86.36 
 
 
514 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  86.36 
 
 
2200 aa  40.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  53.66 
 
 
329 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  86.96 
 
 
121 aa  40  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4444  hypothetical protein  90.48 
 
 
93 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  85.71 
 
 
514 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  90.48 
 
 
582 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>