31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3351 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15560  hypothetical protein  43.43 
 
 
102 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.60918e-14  unclonable  2.12032e-22 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  67.35 
 
 
106 aa  75.1  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  67.35 
 
 
107 aa  75.1  1e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  67.35 
 
 
100 aa  72.4  6e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  61.22 
 
 
104 aa  67.8  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4254  hypothetical protein  67.35 
 
 
68 aa  67.8  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0216195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  57.14 
 
 
106 aa  63.9  2e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0494  hypothetical protein  55.1 
 
 
63 aa  63.2  3e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  45.21 
 
 
95 aa  59.7  4e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 
103 aa  59.7  4e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 
104 aa  59.7  4e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 
97 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  71.43 
 
 
88 aa  57.4  2e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  74.29 
 
 
89 aa  57.8  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  75.76 
 
 
89 aa  57  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  42.47 
 
 
98 aa  54.3  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 
98 aa  54.3  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
97 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 
95 aa  52.4  6e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 
156 aa  52  9e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.97 
 
 
89 aa  51.2  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 
107 aa  50.8  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3348  putative transcriptional regulator  55.26 
 
 
40 aa  48.9  6e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767787  normal  0.423432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 
95 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4811  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 
68 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0622579  hitchhiker  0.00296923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  34.72 
 
 
107 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  45.21 
 
 
98 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3599  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.28 
 
 
87 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  41.43 
 
 
93 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  54.29 
 
 
82 aa  42  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>