255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0948 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  69.61 
 
 
102 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  66.99 
 
 
102 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  65.05 
 
 
104 aa  148  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  64.08 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  55.88 
 
 
106 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  55.88 
 
 
106 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  55.88 
 
 
106 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  59.18 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  53.92 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  53.92 
 
 
106 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  59.6 
 
 
106 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  59.6 
 
 
106 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  55.79 
 
 
99 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  58.59 
 
 
106 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  54.9 
 
 
104 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  56.57 
 
 
99 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  52.94 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  57.58 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  53.4 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  52.94 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  50.98 
 
 
104 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
105 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  53.92 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  57.89 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  54.37 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  54 
 
 
106 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  54.55 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  54.55 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  54.55 
 
 
106 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  56.84 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  53.92 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  55.79 
 
 
106 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  50 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  50.98 
 
 
103 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  50.49 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  50.51 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  51.52 
 
 
99 aa  105  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  51.52 
 
 
99 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  45.45 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  45.63 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  46.53 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  46.08 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  46 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  43.14 
 
 
105 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  45.54 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  45.54 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  45.54 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  44 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  42 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  46.39 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  46.39 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  45.56 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  43 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  40.78 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  41 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  42.73 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  44.44 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  37.35 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  40 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  39.77 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  40.22 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  39.53 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  36.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  38.37 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  38.37 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  41.18 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  38.37 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  44.19 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  31.4 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  35.63 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  36.05 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  35.63 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  37.21 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  36.59 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  34.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  35.37 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  35.37 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  39.36 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  45.45 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  34.15 
 
 
79 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  46.77 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  34.15 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  34.15 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  34.15 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  34.15 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>