68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000905 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000905  lipid A 3-O-deacylase  100 
 
 		 103 aa  213  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06907  hypothetical protein  79.41 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1589  hypothetical protein  61.39 
 
 		 103 aa  136  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2854  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  55.88 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.9 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2292  hypothetical protein  53.47 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0676  hypothetical protein  50.5 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1847  hypothetical protein  50.5 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4627  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5251  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4261  cupin 2 domain-containing protein  59 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0817  cupin 2 domain-containing protein  50.5 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3989  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.49 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0189718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3793  hypothetical protein  49.5 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6918  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.96 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0389028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1476  cupin family protein  49.5 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000241751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3702  cupin 2 domain-containing protein  51.49 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0846  cupin 2 domain-containing protein  49.5 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3511  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.49 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0948  cupin 2 domain-containing protein  50.5 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0837  cupin 2 domain-containing protein  50.5 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.665857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0763  cupin family protein  47.52 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3135  cupin 2 domain-containing protein  46.53 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0804  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0578  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  50.96 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2341  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  51.46 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.443612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0832  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1446  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2347  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  50 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3568  hypothetical protein  48.57 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2206  cupin 2 domain-containing protein  48.57 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2353  cupin 2 domain-containing protein  49.04 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2487  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.08 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2477  cupin 2 domain-containing protein  52.75 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6465  cupin 2 domain-containing protein  49.04 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6099  cupin 2 domain-containing protein  45.63 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1004  hypothetical protein  46.53 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0980  cupin 2, barrel  47.12 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1597  cupin 2, barrel-containing protein  44.12 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00444258  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.249211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1869  hypothetical protein  44.12 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45610  hypothetical protein  49 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2566  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3547  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2846  hypothetical protein  47.52 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341325  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3968  cupin 2, barrel  45.54 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0067  cupin 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0540869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4122  hypothetical protein  45.54 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1495  cupin 2 domain-containing protein  40.78 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1490  hypothetical protein  46.08 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4502  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1558  hypothetical protein  47.57 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645752  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4044  cupin 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1304  hypothetical protein  42.16 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7450  hypothetical protein  41.35 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1497  hypothetical protein  41.75 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389737  normal  0.287846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1914  cupin 2 conserved barrel domain protein  46.08 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5672  cupin 2, barrel  39.81 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6036  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6526  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.2 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.75 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0900  hypothetical protein  36.54 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0995  hypothetical protein  37.36 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.918435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  39.77 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0739  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0011  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 99 aa  42  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>