More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2581 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  75.86 
 
 		 261 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06304  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  72.69 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0908  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  66.92 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  55 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  45.45 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  45.53 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  45.53 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.89 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  44.26 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  44.27 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  43.27 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  43.22 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  40.41 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  42.46 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  44.26 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  39.36 
 
 		 260 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 266 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  41.2 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  43.32 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  43.64 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  44.78 
 
 		 255 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  42.04 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  42.67 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  42.98 
 
 		 278 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  41.49 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  39.6 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.39 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  43.16 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  41.22 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  41.88 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  42.55 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.55 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  41.8 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.55 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  41.45 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0753  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.76 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  42.13 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 273 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  43.75 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  41.63 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  42.28 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  43.27 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.59 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  39.43 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.59 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  39.43 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  43.69 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  44.64 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  42.86 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.26 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>