13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0204 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0202  hypothetical protein  97.8 
 
 		 285 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0300884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1761  hypothetical protein  33.82 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000911876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1548  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  27.98 
 
 		 456 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  29.46 
 
 		 684 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  27.38 
 
 		 456 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  36.84 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2792  hypothetical protein  28.44 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.38 
 
 		 5743 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  26.43 
 
 		 727 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>