70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1680 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.96 
 
 		 323 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  59.55 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  52 
 
 		 323 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  51.46 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  51.92 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  49.02 
 
 		 502 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  43.3 
 
 		 333 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  43.56 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  43.27 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  48.15 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  44.33 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  39.64 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  39.58 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  36.45 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  36.45 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  41.35 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  41.24 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02570  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.498225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  30.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  42.86 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  32.04 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  38.83 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  40.19 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  39.8 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  40.82 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  29.13 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  29.13 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  29.13 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  29.13 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  43.33 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  40.4 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  37.11 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  35.58 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  43.82 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  38 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  36.46 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  42.42 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  33 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  39.36 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  37.23 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  41.25 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  39.6 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  37 
 
 		 112 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  34.78 
 
 		 117 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>