24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1753 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  93.44 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  46.4 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  44.8 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  40.54 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  32.26 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  33.33 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2712  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.548763  unclonable  0.0000000000219887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3114  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  39.08 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  35.04 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  34.15 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.75 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1808  hypothetical protein  22.76 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00352059  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  27.73 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>