37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1527 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  351  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  29.94 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0830  acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3570  acetyltransferase, GNAT family  29.03 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  26.32 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  26.32 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  25.19 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  25.79 
 
 
217 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
119 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.87 
 
 
151 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  25.3 
 
 
313 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.043946  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
296 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5655  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0802774  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  31.68 
 
 
432 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.59 
 
 
168 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5241  diamine N-acetyltransferase  22.75 
 
 
171 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3273  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
286 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0212  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0549808  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  37.5 
 
 
432 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0995  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.477492  normal  0.167483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4907  GCN5-related N-acetyltransferase  22.75 
 
 
171 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  43.33 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02664  hypothetical protein  38.98 
 
 
234 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2134  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
267 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000159892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>