16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4652 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  671  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  73.24 
 
 
455 aa  446  1e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  50.46 
 
 
431 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  51.06 
 
 
320 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  49.85 
 
 
429 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  49.23 
 
 
320 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  39.38 
 
 
444 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  38.15 
 
 
444 aa  182  9e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 
439 aa  117  4e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  55.47 
 
 
128 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  31.92 
 
 
556 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  29.74 
 
 
518 aa  80.5  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 
442 aa  78.2  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  31.25 
 
 
545 aa  67.4  3e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  28.34 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  27.75 
 
 
565 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>