20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0087 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  45.97 
 
 
141 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  56.34 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  43.48 
 
 
159 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  38.64 
 
 
137 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  42.45 
 
 
137 aa  82  2e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  39.86 
 
 
141 aa  81.3  4e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12369e-07  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  41.6 
 
 
226 aa  81.3  4e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  41.48 
 
 
137 aa  80.9  5e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  41.46 
 
 
92 aa  72.4  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  39.55 
 
 
141 aa  70.1  9e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  38.41 
 
 
136 aa  69.7  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  32 
 
 
137 aa  63.5  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
148 aa  53.1  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  34.41 
 
 
133 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4362  PilT protein domain protein  35.42 
 
 
137 aa  49.7  1e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151673  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3390  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  49.3  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10669  hypothetical protein  29.89 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  41.94 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>