38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0057 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  70.37 
 
 
81 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  62.35 
 
 
85 aa  108  2e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  50 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  59.52 
 
 
84 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  52.38 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  41.98 
 
 
81 aa  79  2e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  48.24 
 
 
85 aa  77.8  5e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  45.98 
 
 
87 aa  71.2  4e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  45.98 
 
 
101 aa  70.5  7e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  45.56 
 
 
89 aa  70.5  7e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  41.46 
 
 
83 aa  70.1  9e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13441e-11 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  40.96 
 
 
84 aa  67.4  6e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  47.67 
 
 
83 aa  67.4  6e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  42.05 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  44.32 
 
 
87 aa  63.5  9e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  42.55 
 
 
94 aa  60.8  6e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  60.1  9e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  39.06 
 
 
158 aa  58.5  3e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  1.80482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  35.05 
 
 
97 aa  57  9e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  41.67 
 
 
110 aa  56.6  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  35.63 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  34.48 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  40.68 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  30.86 
 
 
87 aa  53.9  7e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  36.17 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  37.63 
 
 
93 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 
95 aa  52.4  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  36.56 
 
 
93 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  40.28 
 
 
124 aa  51.6  3e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  33.33 
 
 
93 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  34.92 
 
 
130 aa  47.8  5e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  38.54 
 
 
96 aa  47.4  7e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3067  hypothetical protein  47.17 
 
 
53 aa  47  8e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  1.10577e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0020  hypothetical protein  35.19 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>