13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0202 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0202  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0300884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0204  hypothetical protein  97.8 
 
 
285 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1761  hypothetical protein  33.94 
 
 
315 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000911876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1548  hypothetical protein  32.45 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  27.98 
 
 
456 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  29.46 
 
 
684 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  27.38 
 
 
456 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 
222 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  36.84 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2792  hypothetical protein  28.44 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.38 
 
 
5743 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  25.71 
 
 
727 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>