295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2927 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  55.64 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  52.94 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  48.95 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  53.68 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  50 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  52.82 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  50 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  50 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  50.72 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  52.17 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2957  OsmC family protein  50 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  52.11 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  51.05 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  50.72 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  51.09 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  50 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  50.36 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  49.64 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  52.86 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  53.15 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  49.64 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  49.62 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  48.57 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  52.45 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  48.55 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  50.36 
 
 		 140 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  48.55 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  52.45 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  50.35 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  46.76 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  48.2 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  50.75 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1671  OsmC family protein  50 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  48.25 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  47.55 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  50.35 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  49.65 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  48.25 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  46.85 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  47.83 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  47.83 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.23 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  47.55 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  48.95 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  48.2 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  50.36 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  46.43 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  50.36 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  46.43 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  46.43 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  49.65 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  49.65 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  49.65 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  49.65 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  48.92 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  48.25 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  48.25 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  51.13 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  48.95 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  47.45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  46.04 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  46.43 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  46.43 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  48.95 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  46.43 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  48.92 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.55 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  48.18 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  48.94 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  48.95 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  49.28 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  43.75 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  49.64 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  48.95 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.76 
 
 		 143 aa  121  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  42.03 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  42.03 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  42.03 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  46.85 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  43.48 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_003296  RS05440  organic hydroperoxide resistance protein  45.89 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0775032  normal  0.0321725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  48.18 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  45.14 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  50 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  48.59 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3726  OsmC family protein  45 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4803  OsmC family protein  45 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561854  normal  0.509751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  44.53 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  44.2 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>