17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2571 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  283  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  3.26154e-08 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  60.14 
 
 
150 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  62.41 
 
 
150 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  62.41 
 
 
150 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  62.41 
 
 
150 aa  150  6e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  43.7 
 
 
151 aa  82.8  2e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  29.19 
 
 
469 aa  55.1  3e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  36.73 
 
 
155 aa  52  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  36.69 
 
 
150 aa  48.1  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  32.87 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  34.31 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  34.03 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  31.06 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  33.12 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>