14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0043 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0043  type III secretion system protein  100 
 
 		 373 aa  761    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.926613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  31.82 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  30.77 
 
 		 131 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  25.27 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  30.39 
 
 		 116 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  28.79 
 
 		 175 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  30.1 
 
 		 115 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 138 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  30.39 
 
 		 116 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  31.82 
 
 		 130 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>