21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13442 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0797  PilT protein domain protein  44.36 
 
 
130 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.424953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  47.41 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2967  hypothetical protein  38.35 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0071399  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  35.11 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4432  hypothetical protein  34.59 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.352964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  34.59 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1620  PilT protein domain protein  37.88 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  40.6 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5933  hypothetical protein  33.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0433671  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5531  hypothetical protein  33.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.37836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11990  hypothetical protein  36.96 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26300  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.835764  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  24.31 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  29.58 
 
 
143 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  30.88 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0256  hypothetical protein  29.32 
 
 
243 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>