49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0422 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  71.54 
 
 
257 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  68.63 
 
 
257 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  59.29 
 
 
257 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  54.12 
 
 
258 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  54.12 
 
 
258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  51.24 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  48.81 
 
 
256 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 
245 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1684  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  35.95 
 
 
253 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17841  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  35.95 
 
 
253 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17791  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  35.83 
 
 
258 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.600264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18011  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  35.12 
 
 
253 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0919498  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  31.87 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.22 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.1 
 
 
244 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45446  predicted protein  35.38 
 
 
342 aa  98.6  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.505627  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  25.28 
 
 
381 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  27.72 
 
 
183 aa  89  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.17 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.17 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  30.77 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  28.5 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.51 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.92 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27.69 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.86 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.27 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16581  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  32.46 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07831  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.57 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.299977  normal  0.406136 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17801  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.32 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0151  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.03 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.05 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27.69 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1253  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.69 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.72 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.35 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0755  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.4 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.574413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.72 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08081  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.94 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0987518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17141  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  23.81 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.695365  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08071  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.11 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15568  predicted protein  26.24 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10161  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.67 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08371  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.63 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31381  predicted protein  25.5 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>