44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1225 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
248 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  62.2 
 
 
245 aa  314  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  63.37 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  58.13 
 
 
245 aa  298  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  58.9 
 
 
245 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  53.25 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  53.25 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  52.85 
 
 
245 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1253  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  50.62 
 
 
246 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16581  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  47.66 
 
 
264 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  49.58 
 
 
247 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10161  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  46.15 
 
 
276 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08371  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  37.34 
 
 
241 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0151  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  38.17 
 
 
241 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07831  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  38.4 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.299977  normal  0.406136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0755  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  37.23 
 
 
241 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.574413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08071  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  36.8 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08081  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  37.66 
 
 
241 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0987518  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31381  predicted protein  37.75 
 
 
216 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.21 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.52 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.27 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  24.67 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  22.86 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  23.31 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  22.51 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  20.51 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.41 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.61 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.42 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.72 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.16 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  24.87 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  24.87 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.38 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45446  predicted protein  25 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.505627  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  20.75 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  20.29 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  19.9 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.41 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.93 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  23.12 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17841  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  21.71 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18011  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.29 
 
 
253 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0919498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>