48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0423 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  77.59 
 
 
235 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  70.26 
 
 
249 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17141  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  56.6 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.695365  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  55.6 
 
 
238 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  55.6 
 
 
238 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  42.92 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  44.07 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  41.77 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  36.05 
 
 
236 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  35.62 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  35.19 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17801  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  37.02 
 
 
236 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  39.25 
 
 
183 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  35.86 
 
 
381 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.55 
 
 
247 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.32 
 
 
245 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.39 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.85 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.85 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15568  predicted protein  26.61 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.89 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.67 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.69 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.94 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.31 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.76 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1253  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.76 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.4 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.4 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18011  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.07 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0919498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.05 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  24.62 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1684  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.79 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17841  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.05 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45446  predicted protein  27.96 
 
 
342 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.505627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17791  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.73 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.600264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16581  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.93 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.07 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07831  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.76 
 
 
231 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.299977  normal  0.406136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10161  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.32 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24 
 
 
247 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0151  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.93 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08071  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  21.85 
 
 
241 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0755  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  20.17 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.574413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08081  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  20.41 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0987518  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08371  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  20.25 
 
 
241 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>