23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2238 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2504  hypothetical protein  42.03 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0507  hypothetical protein  38.62 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2519  hypothetical protein  34.25 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  36.94 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  35.54 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  34.71 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  34.71 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  35.16 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  34.69 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.96 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0671  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361058  normal  0.889089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  34.41 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  31.52 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.2 
 
 		 176 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  38.3 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  30.93 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  32.32 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.43 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  34.34 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  30.19 
 
 		 177 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>