46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1406 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 177 aa  348  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.29 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.11 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.63 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.76 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.86 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.86 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1976  ATP synthase F1, delta subunit  26.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.106588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.42 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  24.1 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.12 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.38 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.38 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>