44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0974 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0974  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1023  hypothetical protein  81.48 
 
 		 132 aa  222  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.623609  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0889  hypothetical protein  77.69 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0872  hypothetical protein  71.32 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000181159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3194  hypothetical protein  66.92 
 
 		 138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3017  hypothetical protein  74.36 
 
 		 138 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0114113 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3097  hypothetical protein  74.36 
 
 		 138 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3299  hypothetical protein  73.28 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0990  hypothetical protein  73.28 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1093  hypothetical protein  75 
 
 		 126 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1060  hypothetical protein  75 
 
 		 126 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2806  hypothetical protein  71.93 
 
 		 125 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3251  hypothetical protein  65.79 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0435  hypothetical protein  66.06 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05112  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0087  hypothetical protein  61.61 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00321975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3931  hypothetical protein  60.71 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.790566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4956  hypothetical protein  62.28 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03393  hypothetical protein  62.28 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0122  conserved hypothetical protein  62.28 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0126  hypothetical protein  62.28 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03442  conserved inner membrane protein  62.28 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4968  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.715689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4015  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4096  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0114  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545237  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03453  predicted inner membrane protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03404  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3804  hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.968341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0108  conserved hypothetical protein  60.71 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3694  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3913  hypothetical protein  61.4 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4084  hypothetical protein  61.4 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3791  hypothetical protein  61.4 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001245  GTPase  56.78 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0114  hypothetical protein  64.76 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4039  hypothetical protein  60.18 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3900  inner membrane protein YiaW  57.14 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0137  hypothetical protein  57.89 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3030  hypothetical protein  72.97 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.254881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2517  hypothetical protein  29.52 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0542319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4621  hypothetical protein  29.03 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>