42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0970 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0970  major outer membrane lipoprotein, putative  100 
 
 
88 aa  173  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.94431e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  85.23 
 
 
88 aa  150  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  84.09 
 
 
88 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  84.09 
 
 
88 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  84.09 
 
 
88 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  84.09 
 
 
88 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2824  major outer membrane lipoprotein, putative  85.23 
 
 
88 aa  125  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86041e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1083  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 
88 aa  125  2e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.93694e-07  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1007  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 
88 aa  125  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.69001e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1165  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 
88 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.70818e-07  hitchhiker  0.000784933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1295  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 
88 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2898  major outer membrane lipoprotein, putative  86.36 
 
 
88 aa  119  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.56021e-08  hitchhiker  0.000454022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2980  major outer membrane lipoprotein, putative  86.36 
 
 
88 aa  119  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.53296e-07  normal  0.0290676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3077  major outer membrane lipoprotein, putative  86.36 
 
 
88 aa  119  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.56665e-09  hitchhiker  4.40978e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1114  major outer membrane lipoprotein, putative  84.09 
 
 
88 aa  116  1e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0833  major outer membrane lipoprotein, putative  83.72 
 
 
87 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24334e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  47.73 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4194  putative major outer membrane lipoprotein  48.15 
 
 
85 aa  54.3  5e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.719442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  33.71 
 
 
78 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  7.96453e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  33.71 
 
 
81 aa  49.3  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.15895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  33.71 
 
 
78 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 
78 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  8.04906e-08  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 
78 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.37115e-06  decreased coverage  1.67771e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 
78 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  7.10111e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 
78 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  9.17327e-06  hitchhiker  2.17872e-09 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 
78 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.17688e-06  hitchhiker  1.24306e-14 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 
78 aa  48.1  4e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.53676e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 
78 aa  48.1  4e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 
78 aa  47.8  6e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.06733e-11  hitchhiker  3.05308e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  31.46 
 
 
78 aa  47.4  7e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  8.00001e-09  unclonable  1.27827e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.16329e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.01718e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  9.96739e-10  decreased coverage  2.5912e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.68464e-09  unclonable  8.44814e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.33689e-10  decreased coverage  9.78616e-10 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.90635e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  31.76 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.05201e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.09145e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3344  putative outer membrane lipoprotein  35.82 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>