23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4496 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  357  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  37.58 
 
 
245 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2305  putative integral membrane protein  37.89 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  29.56 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21610  hypothetical protein  30.14 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.281638  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  22.78 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  25.79 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  31.01 
 
 
657 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  24.26 
 
 
167 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  22.81 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  20.78 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  22.93 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  24.39 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  21.94 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  21.94 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  25.15 
 
 
165 aa  48.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3282  hypothetical protein  29.27 
 
 
186 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  26.11 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  21.94 
 
 
168 aa  44.7  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  22.58 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>