197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21400  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.327191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  62.41 
 
 
164 aa  183  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
144 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000310805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.19 
 
 
138 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 
138 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2829  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  54.01 
 
 
139 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000111266  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.82 
 
 
137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1560  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.52 
 
 
138 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0327  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.27 
 
 
138 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.247487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20440  hypothetical protein  46.83 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.565275  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.93 
 
 
142 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31410  hypothetical protein  43.18 
 
 
140 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4168  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 
140 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0156126  hitchhiker  0.00300436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2003  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
140 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4598  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.55 
 
 
143 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
138 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  39.26 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  39.26 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.73 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.73608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2613  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.14 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1997  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.61 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.495378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4755  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00586999  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1375  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.96 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1204  PhnB protein  37.32 
 
 
145 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.86 
 
 
144 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.39 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1958  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02340  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
133 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.78 
 
 
322 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  37.12 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3292  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340039  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.89 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2330  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.875189  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0039  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.47 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4456  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346773  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3219  PhnB protein  37.88 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0939991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.76 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.61 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2869  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.33 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.365628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  36.92 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09360  hypothetical protein  37.23 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.502731  normal  0.891606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4028  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.77 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0559791  normal  0.357373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  36.15 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.9 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2265  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.9 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289163  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.09 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4550  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.84 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.17 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  34.56 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4683  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000314859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3596  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000394768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.03 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5280  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.1 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.06 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0029  PhnB protein  33.58 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403111  normal  0.0726467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  34.06 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4475  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4634  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4543  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.88 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364708  normal  0.0270793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4634  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.872407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0307849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  28.79 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  32.37 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.37 
 
 
137 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>