44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  56.13 
 
 
252 aa  275  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  47.24 
 
 
264 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 
253 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  38.37 
 
 
269 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
281 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  42.79 
 
 
252 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  40.33 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  34.8 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  27.72 
 
 
263 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  28.04 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  26.59 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  26.59 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  26.59 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  26.87 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  27.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 
256 aa  89  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  25.37 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  33.47 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  27.13 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  27.1 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39.26 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
279 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  23.97 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  35.05 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  33.51 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  34.43 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  22.18 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  29.85 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  35.46 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>