234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0649 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  97.52 
 
 
325 aa  653  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  96.64 
 
 
342 aa  657  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  98.18 
 
 
330 aa  673  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.05795e-06  hitchhiker  6.05277e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  95.03 
 
 
325 aa  636  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  9.76669e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  95.96 
 
 
325 aa  644  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  8.25139e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  99.39 
 
 
330 aa  679  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.87487e-06  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  95.76 
 
 
330 aa  658  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  96.36 
 
 
330 aa  664  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.49089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
330 aa  683  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.2106e-05  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  89.36 
 
 
329 aa  620  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.93174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  86.63 
 
 
329 aa  603  1e-172  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.38522e-07  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0813  fructose-1,6-bisphosphatase  87.23 
 
 
329 aa  604  1e-172  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.66321e-06  hitchhiker  0.000279081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0531  fructose-1,6-bisphosphatase  85.76 
 
 
330 aa  600  1e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.012262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  86.67 
 
 
330 aa  593  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  85.41 
 
 
329 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.61659e-07  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  76.18 
 
 
320 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.76806e-08  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  62.7 
 
 
319 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.56898e-08  unclonable  5.22982e-12 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4614  fructose-1,6-bisphosphatase  59.13 
 
 
322 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
325 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  58.7 
 
 
337 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  6.16027e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  63.14 
 
 
323 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  60.26 
 
 
336 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1278  D-fructose 1,6-bisphosphatase  55.31 
 
 
322 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38051e-08  normal  0.25369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  57.37 
 
 
337 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  59.19 
 
 
338 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87853e-08 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  54.85 
 
 
336 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  54.85 
 
 
336 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  57.79 
 
 
335 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  57.47 
 
 
338 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  54.55 
 
 
336 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  56.65 
 
 
336 aa  357  1e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  57.65 
 
 
338 aa  357  2e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  54.1 
 
 
335 aa  357  2e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  53.94 
 
 
336 aa  357  2e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  57.93 
 
 
335 aa  357  2e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  58.69 
 
 
334 aa  355  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.01477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  58.12 
 
 
338 aa  355  6e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  53.64 
 
 
336 aa  355  6e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  56.19 
 
 
338 aa  355  6e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  53.64 
 
 
336 aa  355  7e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  56.13 
 
 
333 aa  355  7e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  53.64 
 
 
336 aa  355  7e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  53.94 
 
 
336 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  57.79 
 
 
338 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  56.09 
 
 
339 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  56.07 
 
 
337 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  53.94 
 
 
336 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  56.17 
 
 
334 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  55 
 
 
338 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  57.05 
 
 
322 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  55.19 
 
 
335 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  53.94 
 
 
337 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0541  fructose-1,6-bisphosphatase  55.49 
 
 
327 aa  349  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  55 
 
 
338 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53 
 
 
331 aa  348  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.25166e-05  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  51.84 
 
 
364 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  54.06 
 
 
339 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  55.84 
 
 
337 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  54.77 
 
 
339 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  54.84 
 
 
339 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  54.34 
 
 
335 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  55.84 
 
 
335 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  55.52 
 
 
335 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  8.37949e-09 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  56.03 
 
 
338 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  53.75 
 
 
337 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  53.75 
 
 
339 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  54.46 
 
 
339 aa  345  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  53.44 
 
 
337 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  55.7 
 
 
338 aa  344  9e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  53.44 
 
 
337 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  53.44 
 
 
337 aa  343  3e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  53.44 
 
 
337 aa  343  3e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  55.99 
 
 
335 aa  342  6e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0530  fructose-1,6-bisphosphatase  55.14 
 
 
327 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.059521  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  54.52 
 
 
338 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  54.22 
 
 
336 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.3 
 
 
364 aa  337  2e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  54.22 
 
 
341 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  52.55 
 
 
357 aa  331  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  54.55 
 
 
339 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  52.8 
 
 
338 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  54.55 
 
 
339 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1857  fructose-1,6-bisphosphatase  53.18 
 
 
334 aa  330  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  2.62461e-10  hitchhiker  0.000253993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  48.96 
 
 
365 aa  328  5e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  49.41 
 
 
365 aa  326  4e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  4.22669e-08  decreased coverage  8.00022e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50 
 
 
343 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.89 
 
 
369 aa  320  2e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  49.84 
 
 
333 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  48.74 
 
 
358 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  48.33 
 
 
378 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.4 
 
 
357 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1481  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.97 
 
 
351 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.1 
 
 
371 aa  274  1e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0943  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.02 
 
 
348 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>