31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  100 
 
 
97 aa  205  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0440  prophage LambdaBa04, Gp54  54.65 
 
 
100 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.8645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0461  prophage lambdaba04, gp54  54.65 
 
 
100 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3431  Gp54 protein  53.49 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0094955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3512  phage-like protein  53.49 
 
 
98 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.88204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3433  HNH endonuclease  51.16 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  42.5 
 
 
105 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  41.67 
 
 
104 aa  52.8  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  41.67 
 
 
104 aa  52.8  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  35.8 
 
 
127 aa  51.6  3e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  36 
 
 
116 aa  52  3e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.58985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  38.55 
 
 
120 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  38.55 
 
 
120 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  34.94 
 
 
99 aa  49.7  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  34.94 
 
 
99 aa  49.7  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  34.67 
 
 
116 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.14 
 
 
135 aa  47  8e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  31.17 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  29.67 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3789  hypothetical protein  59.46 
 
 
41 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.029397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  29.7 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  29.67 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  41.56 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.98354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  29.67 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  36.11 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  40.26 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3890  hypothetical protein  34.85 
 
 
367 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5801  hypothetical protein  34.85 
 
 
367 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  34.72 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  34.72 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  32 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>